树根部分即理学（taphysics），涉及哲学、方法论等领域，包括阴阳学、老庄哲学、朱熹理学、王阳明心法等。
这些内容由最核心的人员，如笛卡尔等，进行研究和转化。
树干部分则称为物学（physics），涵盖中华典籍中的数学、天文、地理、历法等基础研究。
由于内容复杂，由核心人员主导，同时普通人员如费马、艾基纳·帕斯卡等也共同参与。
树枝部分简化为医学、机械学和社会道德三大分科，涵盖医术、航海、工艺、农艺、戏剧等领域。
由于内容庞杂且晦涩难懂，梅森会允许外围学者如伽利略和海尔蒙特等共同参与研究。‘
他们虽未加入梅森会，但对新奇的学术知识充满兴趣，与梅森会往来密切。
梅森带领六十多名梅森会成员参加赴美洲观察团的原因主要有几个：
其一，黎塞留要求梅森会尽快获取麻醉剂、消毒剂、石油提炼等技术，以提升法兰西综合实力，并避免对美洲产生依赖。
其二，梅森会学者在研究中华典籍时遇到许多难以理解的内容，希望到美洲寻找答案，如算盘的作用、天球坐标系中的阴阳概念等。
其三，海尔蒙特在研究火药时，意外发现硝酸、硫酸与棉花混合能生成一种不稳定的爆炸物质。
作为梅森会的外围成员，他将这一发现寄给了梅森，期盼梅森能召集更多炼金师共同研究。
起初，梅森对炼金术并不热衷。然而，欧洲刺客兄弟会的多次成功刺杀让教皇心生忧虑。教皇责令梅森迅速查明步枪和子弹的制造方法，并探寻防御之道。
随后，梅森得知罗科塔岛已被远征军团占领，但岛上仍有部分东方典籍未能及时运回欧洲。
此次前来，他也想趁机获取这些典籍，并将它们带回欧洲。
听完梅森的交代，冷秉眼神微凝，沉声发问：
“我有两个疑问：
其一，黎塞留对我远征军团持何态度？
其二，今年以来，里奥斯与你联络过几次，具体时间为何？”
梅森看了冷秉一眼，随即目光投向了哈维，带着询问之意。
“这次审讯，是王子阁下的意思。我代表美洲的方济各会，也代表如今的‘先知天主教’。
而这位是冷秉将军，他是王子阁下的亲信，还请有问必答。”哈维抬了抬手，缓缓介绍道。
听到介绍，梅森的态度立刻变得恭敬，他正色解释道：
“对黎塞留大主教来说，无论是权利、财富还是信仰都没有法兰西王国的未来重要。
远征军团削弱了西班牙在美洲殖民地的势力，使得大量的金银无法运回塞维利亚，这一举措极大削弱了哈布斯堡联盟的力量，尤其使得天主教盟军的军费和物资供应困难。
因此，黎塞留大人对远征军团持欣赏和支持态度。
至于里奥斯，今年就给我捎过一次信笺，信笺是二月份从新阿姆斯特丹发出的，自那以后，就没有再联络过。”
听到这话，冷秉微微颔首，看来这个梅森并未撒谎。